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Molecular dynamics simulation study for LRH-1: Interaction with fragments of BHP and function of phospholipid ligand
其他题名Molecular dynamics simulation study for LRH-1: Interaction with fragments of BHP and function of phospholipid ligand
Zhang T(张涛); Shi LW(史良伟); Zhou JH(周俊红); Zhu RX(朱瑞新); Chen MB(陈敏伯)
2008
发表期刊Proteins
ISSN0887-3585
卷号70期号:4页码:1527-1539
摘要The liver receptor homolog-1 (LRH-1) is an important transcriptional factor in the process of cholesterol and bile acids metabolism. In this article, molecular dynamics simulation for six systems with total 60 ns is employed to study LRH-1. LRH-1/phospholipid and LRH-1/SHP (fragments) interactions are analyzed by counting atomic contact number, identifying hydrogen bonds, and estimating binding free energies (by MM-PB/SA and N-mode analysis). Through integrating our modeling result with previous experimental data, deeper understandings to LRH-1/SHP interaction are obtained, and functions Of the phospholipid ligand in LRH-1 are proposed.
学科领域计算机化学与化学信息学
部门归属上海有机所; 华东理工大学
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收录类别SCI
语种英语
WOS记录号WOS:000253567400040
引用统计
被引频次:2[WOS]   [WOS记录]     [WOS相关记录]
文献类型期刊论文
条目标识符http://ir.sioc.ac.cn/handle/331003/27725
专题上海有机化学研究所
通讯作者Chen MB(陈敏伯)
推荐引用方式
GB/T 7714
Zhang T,Shi LW,Zhou JH,et al. Molecular dynamics simulation study for LRH-1: Interaction with fragments of BHP and function of phospholipid ligand[J]. Proteins,2008,70(4):1527-1539.
APA 张涛,史良伟,周俊红,朱瑞新,&陈敏伯.(2008).Molecular dynamics simulation study for LRH-1: Interaction with fragments of BHP and function of phospholipid ligand.Proteins,70(4),1527-1539.
MLA 张涛,et al."Molecular dynamics simulation study for LRH-1: Interaction with fragments of BHP and function of phospholipid ligand".Proteins 70.4(2008):1527-1539.
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